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- Volume 5 (2001)
- Numéro 1
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Single strand conformation polymorphism (SSCP) detection in six genes in Portuguese indigenous sheep breed “Churra da Terra Quente”
Editor's Notes
Received 7 August 2000, accepted 19 January 2001
Résumé
Détection de polymorphismes de conformation monocaténaires (SSCP – Single Strand Conformational Polymorphism) dans six gènes de la race indigène ovine portugaise “Churra da Terra Quente”
L’objectif de ce travail a été l’étude de la variabilité génétique de six gènes dans 40 animaux de la race ovine (Ovis aries) indigène portugaise “Churra da Terra Quente”. Une méthode non-radioactive a été optimisée pour la détection de polymorphismes de conformation monocaténaires (SSCP – Single Strand Conformational Polymorphism). À partir d’ADN génomique, il a été amplifié par PCR six fragments derivant de l’exon 1 du gène de l’alpha-lactoalbumine; des exons 10 et 11 du gène de l’alphas1-caseíne ; de l’exon 7 du gène de la beta-caséine ; de l’exon 4 du gène de la k-caséine ; des exons 4 et 5 du gène de l’hormone de croissance et l’exon 6 du gène du récepteur de l’hormone de croissance. On a observé des polymorphismes pour cinq des produits PCR. Les fragments de la k-caséine et du récepteur de l’hormone de croissance se sont montrés monomorphiques. Pour l’alpha-lactoalbumine et l’alphas1-caséine on a observé trois profils de conformation, pour la beta-caséine et l’exon 4 de l’hormone de croissance deux profils et pour l’exon 5 de l’hormone de croissance cinq profils. Nos résultats montrent que la race ovine “Churra da Terra Quente” a une variabilité génétique élevée, ce qui permet d’envisager des applications intéressantes dans une programme de sélection et aussi la définition d’une stratégie pour la préservation de la diversité génétique. Ces résultats montrent que PCR-SSCP est un outil intéressant pour l’évaluation de la variabilité génétique.
Abstract
Evaluation of the genetic diversity for six genes in forty animals of the Portuguese indigenous sheep breed (Ovis aries) “Churra da Terra Quente” was done. A non-radioactive method to allow single-strand conformation polymorphism (SSCP) detection was optimised, starting from genomic DNAand PCR amplification of seven fragments: exon 1 of the alpha-lactalbumin gene; exons 10 and 11 of the alphas1-casein gene; exon 7 of the beta-casein gene; exon 4 of the k-casein gene; exons 4 and 5 of the growth hormone gene and exon 6 of the growth hormone receptor gene. Polymorphisms were detected in five of the seven PCR products. Only k-casein and growth hormone receptor were monomorphic. alpha-lactalbumin and alphas1-casein exons showed three conformational patterns, beta-casein and growth hormone exon 4 showed two electrophoretic patterns and growth hormone exon 5 showed five conformational patterns. These data provide evidence that “Churra da Terra Quente” has a high genetic variability, which opens interesting prospects for future selection programs and also for preservation strategies. Also, our data show that PCR-SSCP is an appropriate tool for evaluating genetic variability.